Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM21P19474 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms