Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGB6P18564 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB6P18564 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.9 ms