Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VCLP18206 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VCLP18206 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VCLP18206 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VCLP18206 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VCLP18206 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VCLP18206 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VCLP18206 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VCLP18206 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VCLP18206 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VCLP18206 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VCLP18206 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VCLP18206 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VCLP18206 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VCLP18206 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VCLP18206 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VCLP18206 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VCLP18206 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VCLP18206 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VCLP18206 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VCLP18206 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VCLP18206 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VCLP18206 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VCLP18206 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VCLP18206 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VCLP18206 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VCLP18206 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VCLP18206 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VCLP18206 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VCLP18206 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VCLP18206 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VCLP18206 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VCLP18206 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VCLP18206 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VCLP18206 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VCLP18206 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VCLP18206 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VCLP18206 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VCLP18206 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VCLP18206 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VCLP18206 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VCLP18206 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VCLP18206 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VCLP18206 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VCLP18206 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VCLP18206 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VCLP18206 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VCLP18206 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VCLP18206 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VCLP18206 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VCLP18206 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VCLP18206 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VCLP18206 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VCLP18206 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VCLP18206 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VCLP18206 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VCLP18206 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VCLP18206 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VCLP18206 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VCLP18206 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VCLP18206 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VCLP18206 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VCLP18206 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VCLP18206 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VCLP18206 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VCLP18206 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VCLP18206 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VCLP18206 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VCLP18206 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VCLP18206 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VCLP18206 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VCLP18206 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VCLP18206 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VCLP18206 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VCLP18206 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VCLP18206 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VCLP18206 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VCLP18206 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VCLP18206 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VCLP18206 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VCLP18206 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VCLP18206 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VCLP18206 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCLP18206 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCLP18206 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCLP18206 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCLP18206 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VCLP18206 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCLP18206 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCLP18206 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCLP18206 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCLP18206 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCLP18206 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCLP18206 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VCLP18206 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCLP18206 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCLP18206 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VCLP18206 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VCLP18206 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VCLP18206 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms