Protein–RNA interactions for Protein: P18084

ITGB5, Integrin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5P18084 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGB5P18084 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB5P18084 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGB5P18084 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGB5P18084 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGB5P18084 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms