Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMD1P17707 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMD1P17707 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMD1P17707 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
AMD1P17707 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMD1P17707 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
AMD1P17707 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMD1P17707 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMD1P17707 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMD1P17707 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMD1P17707 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMD1P17707 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
AMD1P17707 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AMD1P17707 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
AMD1P17707 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AMD1P17707 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AMD1P17707 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AMD1P17707 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AMD1P17707 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AMD1P17707 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMD1P17707 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMD1P17707 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMD1P17707 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMD1P17707 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMD1P17707 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMD1P17707 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMD1P17707 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMD1P17707 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMD1P17707 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMD1P17707 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMD1P17707 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMD1P17707 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMD1P17707 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMD1P17707 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMD1P17707 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMD1P17707 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMD1P17707 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMD1P17707 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMD1P17707 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
AMD1P17707 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMD1P17707 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMD1P17707 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMD1P17707 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMD1P17707 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMD1P17707 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMD1P17707 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMD1P17707 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMD1P17707 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMD1P17707 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMD1P17707 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMD1P17707 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMD1P17707 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMD1P17707 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMD1P17707 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMD1P17707 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMD1P17707 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMD1P17707 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMD1P17707 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMD1P17707 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMD1P17707 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMD1P17707 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMD1P17707 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
AMD1P17707 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMD1P17707 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMD1P17707 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMD1P17707 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMD1P17707 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMD1P17707 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMD1P17707 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMD1P17707 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMD1P17707 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMD1P17707 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AMD1P17707 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMD1P17707 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMD1P17707 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMD1P17707 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMD1P17707 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMD1P17707 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMD1P17707 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMD1P17707 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMD1P17707 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMD1P17707 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
AMD1P17707 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
AMD1P17707 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
AMD1P17707 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMD1P17707 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMD1P17707 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AMD1P17707 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMD1P17707 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMD1P17707 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMD1P17707 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMD1P17707 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMD1P17707 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AMD1P17707 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMD1P17707 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMD1P17707 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMD1P17707 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMD1P17707 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMD1P17707 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMD1P17707 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms