Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
UBTFP17480 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
UBTFP17480 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
UBTFP17480 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
UBTFP17480 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
UBTFP17480 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
UBTFP17480 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
UBTFP17480 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
UBTFP17480 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
UBTFP17480 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
UBTFP17480 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
UBTFP17480 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
UBTFP17480 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
UBTFP17480 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
UBTFP17480 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
UBTFP17480 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
UBTFP17480 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
UBTFP17480 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
UBTFP17480 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
UBTFP17480 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
UBTFP17480 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
UBTFP17480 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.66
UBTFP17480 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
UBTFP17480 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
UBTFP17480 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
UBTFP17480 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
UBTFP17480 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
UBTFP17480 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
UBTFP17480 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
UBTFP17480 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC37.93■■■■□ 3.66
UBTFP17480 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
UBTFP17480 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
UBTFP17480 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
UBTFP17480 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
UBTFP17480 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
UBTFP17480 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
UBTFP17480 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
UBTFP17480 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
UBTFP17480 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
UBTFP17480 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
UBTFP17480 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
UBTFP17480 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
UBTFP17480 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
UBTFP17480 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
UBTFP17480 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC37.89■■■■□ 3.66
UBTFP17480 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
UBTFP17480 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
UBTFP17480 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
UBTFP17480 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
UBTFP17480 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
UBTFP17480 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
UBTFP17480 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
UBTFP17480 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
UBTFP17480 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
UBTFP17480 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
UBTFP17480 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
UBTFP17480 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
UBTFP17480 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
UBTFP17480 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
UBTFP17480 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
UBTFP17480 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
UBTFP17480 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
UBTFP17480 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
UBTFP17480 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
UBTFP17480 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
UBTFP17480 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
UBTFP17480 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
UBTFP17480 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
UBTFP17480 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
UBTFP17480 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
UBTFP17480 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
UBTFP17480 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
UBTFP17480 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
UBTFP17480 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
UBTFP17480 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
UBTFP17480 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
UBTFP17480 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
UBTFP17480 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
UBTFP17480 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
UBTFP17480 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
UBTFP17480 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
UBTFP17480 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
UBTFP17480 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
UBTFP17480 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
UBTFP17480 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
UBTFP17480 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC37.77■■■■□ 3.64
UBTFP17480 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
UBTFP17480 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
UBTFP17480 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
UBTFP17480 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
UBTFP17480 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
UBTFP17480 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
UBTFP17480 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
UBTFP17480 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
UBTFP17480 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
UBTFP17480 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
UBTFP17480 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
UBTFP17480 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
UBTFP17480 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC37.75■■■■□ 3.63
UBTFP17480 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms