Protein–RNA interactions for Protein: P17066

HSPA6, Heat shock 70 kDa protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA6P17066 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSPA6P17066 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSPA6P17066 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSPA6P17066 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSPA6P17066 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSPA6P17066 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSPA6P17066 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSPA6P17066 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSPA6P17066 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSPA6P17066 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSPA6P17066 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HSPA6P17066 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSPA6P17066 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HSPA6P17066 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSPA6P17066 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HSPA6P17066 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HSPA6P17066 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HSPA6P17066 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HSPA6P17066 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HSPA6P17066 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HSPA6P17066 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HSPA6P17066 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HSPA6P17066 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
HSPA6P17066 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
HSPA6P17066 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HSPA6P17066 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HSPA6P17066 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HSPA6P17066 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HSPA6P17066 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HSPA6P17066 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HSPA6P17066 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HSPA6P17066 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HSPA6P17066 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HSPA6P17066 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
HSPA6P17066 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HSPA6P17066 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HSPA6P17066 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HSPA6P17066 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HSPA6P17066 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HSPA6P17066 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HSPA6P17066 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HSPA6P17066 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HSPA6P17066 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HSPA6P17066 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HSPA6P17066 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HSPA6P17066 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HSPA6P17066 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HSPA6P17066 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSPA6P17066 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSPA6P17066 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSPA6P17066 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSPA6P17066 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSPA6P17066 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSPA6P17066 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HSPA6P17066 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HSPA6P17066 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HSPA6P17066 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms