Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABRA1P14867 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABRA1P14867 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABRA1P14867 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRA1P14867 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRA1P14867 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRA1P14867 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms