Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB3P14651 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms