Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNNT1P13805 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNT1P13805 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNT1P13805 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNT1P13805 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNT1P13805 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNT1P13805 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNT1P13805 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNT1P13805 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNT1P13805 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNT1P13805 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNT1P13805 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNT1P13805 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNT1P13805 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNT1P13805 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNT1P13805 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNT1P13805 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNT1P13805 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNT1P13805 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNT1P13805 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNT1P13805 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNT1P13805 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNT1P13805 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNT1P13805 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNT1P13805 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNT1P13805 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNT1P13805 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNT1P13805 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNT1P13805 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNT1P13805 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNT1P13805 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNT1P13805 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNT1P13805 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNT1P13805 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms