Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RARGP13631 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARGP13631 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARGP13631 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARGP13631 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARGP13631 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARGP13631 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RARGP13631 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RARGP13631 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RARGP13631 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RARGP13631 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RARGP13631 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RARGP13631 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RARGP13631 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RARGP13631 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RARGP13631 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RARGP13631 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RARGP13631 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RARGP13631 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RARGP13631 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RARGP13631 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RARGP13631 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RARGP13631 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RARGP13631 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RARGP13631 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RARGP13631 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RARGP13631 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RARGP13631 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RARGP13631 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RARGP13631 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RARGP13631 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RARGP13631 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RARGP13631 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RARGP13631 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RARGP13631 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RARGP13631 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RARGP13631 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RARGP13631 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RARGP13631 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RARGP13631 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RARGP13631 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RARGP13631 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RARGP13631 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RARGP13631 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RARGP13631 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RARGP13631 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RARGP13631 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RARGP13631 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RARGP13631 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RARGP13631 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RARGP13631 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RARGP13631 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RARGP13631 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RARGP13631 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARGP13631 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARGP13631 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RARGP13631 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARGP13631 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARGP13631 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARGP13631 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARGP13631 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARGP13631 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARGP13631 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARGP13631 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARGP13631 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARGP13631 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARGP13631 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARGP13631 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARGP13631 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARGP13631 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARGP13631 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARGP13631 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARGP13631 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARGP13631 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARGP13631 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARGP13631 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARGP13631 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARGP13631 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARGP13631 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARGP13631 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARGP13631 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARGP13631 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARGP13631 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARGP13631 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARGP13631 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARGP13631 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARGP13631 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARGP13631 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RARGP13631 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RARGP13631 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RARGP13631 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RARGP13631 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RARGP13631 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RARGP13631 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RARGP13631 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RARGP13631 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RARGP13631 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RARGP13631 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RARGP13631 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RARGP13631 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms