Protein–RNA interactions for Protein: P13349

MYF5, Myogenic factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF5P13349 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYF5P13349 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYF5P13349 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYF5P13349 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYF5P13349 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYF5P13349 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYF5P13349 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYF5P13349 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYF5P13349 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYF5P13349 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYF5P13349 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYF5P13349 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYF5P13349 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYF5P13349 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYF5P13349 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYF5P13349 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYF5P13349 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYF5P13349 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYF5P13349 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYF5P13349 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYF5P13349 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYF5P13349 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYF5P13349 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYF5P13349 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYF5P13349 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYF5P13349 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYF5P13349 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYF5P13349 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYF5P13349 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYF5P13349 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYF5P13349 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYF5P13349 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYF5P13349 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYF5P13349 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYF5P13349 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYF5P13349 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYF5P13349 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MYF5P13349 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYF5P13349 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYF5P13349 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYF5P13349 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYF5P13349 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYF5P13349 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYF5P13349 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYF5P13349 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYF5P13349 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYF5P13349 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYF5P13349 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYF5P13349 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYF5P13349 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYF5P13349 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYF5P13349 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYF5P13349 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYF5P13349 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYF5P13349 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYF5P13349 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYF5P13349 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYF5P13349 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYF5P13349 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYF5P13349 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYF5P13349 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MYF5P13349 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MYF5P13349 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYF5P13349 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MYF5P13349 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYF5P13349 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYF5P13349 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYF5P13349 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MYF5P13349 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYF5P13349 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYF5P13349 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYF5P13349 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYF5P13349 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYF5P13349 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYF5P13349 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYF5P13349 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYF5P13349 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYF5P13349 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYF5P13349 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYF5P13349 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYF5P13349 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYF5P13349 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MYF5P13349 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYF5P13349 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYF5P13349 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYF5P13349 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYF5P13349 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYF5P13349 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYF5P13349 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYF5P13349 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYF5P13349 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYF5P13349 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYF5P13349 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYF5P13349 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYF5P13349 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYF5P13349 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYF5P13349 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYF5P13349 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYF5P13349 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYF5P13349 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms