Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SFTPCP11686 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFTPCP11686 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SFTPCP11686 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SFTPCP11686 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFTPCP11686 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SFTPCP11686 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SFTPCP11686 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SFTPCP11686 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SFTPCP11686 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFTPCP11686 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SFTPCP11686 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SFTPCP11686 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFTPCP11686 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SFTPCP11686 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SFTPCP11686 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFTPCP11686 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFTPCP11686 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFTPCP11686 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SFTPCP11686 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SFTPCP11686 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
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