Protein–RNA interactions for Protein: P10600

TGFB3, Transforming growth factor beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB3P10600 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TGFB3P10600 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TGFB3P10600 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TGFB3P10600 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TGFB3P10600 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TGFB3P10600 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TGFB3P10600 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TGFB3P10600 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TGFB3P10600 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TGFB3P10600 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TGFB3P10600 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TGFB3P10600 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TGFB3P10600 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TGFB3P10600 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TGFB3P10600 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TGFB3P10600 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TGFB3P10600 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TGFB3P10600 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TGFB3P10600 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TGFB3P10600 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TGFB3P10600 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TGFB3P10600 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TGFB3P10600 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TGFB3P10600 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TGFB3P10600 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TGFB3P10600 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TGFB3P10600 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TGFB3P10600 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TGFB3P10600 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TGFB3P10600 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TGFB3P10600 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TGFB3P10600 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TGFB3P10600 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TGFB3P10600 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TGFB3P10600 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TGFB3P10600 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TGFB3P10600 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TGFB3P10600 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TGFB3P10600 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TGFB3P10600 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TGFB3P10600 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TGFB3P10600 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TGFB3P10600 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TGFB3P10600 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TGFB3P10600 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TGFB3P10600 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms