Protein–RNA interactions for Protein: P10451

SPP1, Osteopontin, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP1P10451 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPP1P10451 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPP1P10451 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPP1P10451 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SPP1P10451 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPP1P10451 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPP1P10451 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPP1P10451 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPP1P10451 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPP1P10451 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPP1P10451 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPP1P10451 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPP1P10451 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SPP1P10451 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPP1P10451 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPP1P10451 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPP1P10451 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPP1P10451 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SPP1P10451 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPP1P10451 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPP1P10451 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPP1P10451 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPP1P10451 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPP1P10451 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPP1P10451 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPP1P10451 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPP1P10451 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPP1P10451 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPP1P10451 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SPP1P10451 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPP1P10451 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPP1P10451 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SPP1P10451 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPP1P10451 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPP1P10451 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPP1P10451 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPP1P10451 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPP1P10451 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPP1P10451 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SPP1P10451 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPP1P10451 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPP1P10451 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPP1P10451 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPP1P10451 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPP1P10451 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPP1P10451 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPP1P10451 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPP1P10451 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPP1P10451 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPP1P10451 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPP1P10451 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPP1P10451 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPP1P10451 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPP1P10451 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPP1P10451 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPP1P10451 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPP1P10451 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPP1P10451 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPP1P10451 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPP1P10451 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPP1P10451 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPP1P10451 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPP1P10451 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPP1P10451 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPP1P10451 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPP1P10451 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPP1P10451 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPP1P10451 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPP1P10451 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPP1P10451 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPP1P10451 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPP1P10451 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPP1P10451 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPP1P10451 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPP1P10451 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPP1P10451 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPP1P10451 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPP1P10451 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SPP1P10451 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SPP1P10451 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPP1P10451 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPP1P10451 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPP1P10451 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPP1P10451 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPP1P10451 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPP1P10451 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPP1P10451 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPP1P10451 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPP1P10451 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPP1P10451 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPP1P10451 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPP1P10451 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPP1P10451 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPP1P10451 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPP1P10451 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPP1P10451 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPP1P10451 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPP1P10451 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPP1P10451 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPP1P10451 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms