Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRGAP2CP0DJJ0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRGAP2CP0DJJ0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRGAP2CP0DJJ0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRGAP2CP0DJJ0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRGAP2CP0DJJ0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRGAP2CP0DJJ0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRGAP2CP0DJJ0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRGAP2CP0DJJ0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRGAP2CP0DJJ0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRGAP2CP0DJJ0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP2CP0DJJ0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP2CP0DJJ0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP2CP0DJJ0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP2CP0DJJ0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP2CP0DJJ0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP2CP0DJJ0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP2CP0DJJ0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP2CP0DJJ0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP2CP0DJJ0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP2CP0DJJ0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP2CP0DJJ0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRGAP2CP0DJJ0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRGAP2CP0DJJ0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRGAP2CP0DJJ0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRGAP2CP0DJJ0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRGAP2CP0DJJ0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRGAP2CP0DJJ0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SRGAP2CP0DJJ0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRGAP2CP0DJJ0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRGAP2CP0DJJ0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRGAP2CP0DJJ0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRGAP2CP0DJJ0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRGAP2CP0DJJ0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRGAP2CP0DJJ0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRGAP2CP0DJJ0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRGAP2CP0DJJ0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRGAP2CP0DJJ0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRGAP2CP0DJJ0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRGAP2CP0DJJ0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRGAP2CP0DJJ0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SRGAP2CP0DJJ0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SRGAP2CP0DJJ0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms