Protein–RNA interactions for Protein: P07858

CTSB, Cathepsin B, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSBP07858 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSBP07858 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSBP07858 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSBP07858 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSBP07858 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSBP07858 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSBP07858 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSBP07858 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSBP07858 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSBP07858 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSBP07858 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSBP07858 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSBP07858 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSBP07858 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSBP07858 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSBP07858 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSBP07858 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSBP07858 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSBP07858 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSBP07858 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSBP07858 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSBP07858 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSBP07858 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSBP07858 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSBP07858 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSBP07858 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSBP07858 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSBP07858 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSBP07858 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSBP07858 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSBP07858 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSBP07858 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSBP07858 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSBP07858 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSBP07858 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSBP07858 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSBP07858 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSBP07858 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSBP07858 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSBP07858 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSBP07858 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSBP07858 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSBP07858 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSBP07858 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSBP07858 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSBP07858 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSBP07858 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSBP07858 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSBP07858 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSBP07858 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSBP07858 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSBP07858 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSBP07858 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSBP07858 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSBP07858 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSBP07858 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSBP07858 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSBP07858 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSBP07858 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSBP07858 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSBP07858 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSBP07858 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CTSBP07858 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSBP07858 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSBP07858 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSBP07858 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSBP07858 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSBP07858 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSBP07858 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSBP07858 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSBP07858 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSBP07858 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSBP07858 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSBP07858 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSBP07858 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSBP07858 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSBP07858 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSBP07858 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSBP07858 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSBP07858 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSBP07858 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSBP07858 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSBP07858 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSBP07858 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSBP07858 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSBP07858 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSBP07858 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSBP07858 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSBP07858 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSBP07858 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSBP07858 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSBP07858 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSBP07858 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSBP07858 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSBP07858 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSBP07858 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSBP07858 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSBP07858 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSBP07858 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSBP07858 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms