Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSN3P07498 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSN3P07498 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSN3P07498 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSN3P07498 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CSN3P07498 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CSN3P07498 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSN3P07498 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSN3P07498 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSN3P07498 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSN3P07498 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSN3P07498 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSN3P07498 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CSN3P07498 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSN3P07498 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSN3P07498 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSN3P07498 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSN3P07498 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSN3P07498 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSN3P07498 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSN3P07498 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSN3P07498 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CSN3P07498 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSN3P07498 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSN3P07498 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CSN3P07498 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSN3P07498 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSN3P07498 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSN3P07498 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSN3P07498 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSN3P07498 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSN3P07498 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSN3P07498 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSN3P07498 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSN3P07498 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CSN3P07498 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSN3P07498 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSN3P07498 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSN3P07498 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSN3P07498 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSN3P07498 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSN3P07498 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSN3P07498 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSN3P07498 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSN3P07498 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSN3P07498 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSN3P07498 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSN3P07498 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSN3P07498 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CSN3P07498 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSN3P07498 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSN3P07498 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSN3P07498 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSN3P07498 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSN3P07498 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CSN3P07498 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSN3P07498 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSN3P07498 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSN3P07498 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSN3P07498 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSN3P07498 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSN3P07498 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSN3P07498 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSN3P07498 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSN3P07498 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSN3P07498 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSN3P07498 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSN3P07498 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CSN3P07498 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSN3P07498 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSN3P07498 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSN3P07498 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSN3P07498 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSN3P07498 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSN3P07498 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSN3P07498 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSN3P07498 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSN3P07498 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSN3P07498 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSN3P07498 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSN3P07498 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSN3P07498 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CSN3P07498 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSN3P07498 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSN3P07498 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CSN3P07498 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSN3P07498 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSN3P07498 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSN3P07498 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSN3P07498 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSN3P07498 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSN3P07498 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSN3P07498 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSN3P07498 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSN3P07498 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSN3P07498 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSN3P07498 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSN3P07498 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSN3P07498 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSN3P07498 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms