Protein–RNA interactions for Protein: P07359

GP1BA, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BAP07359 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GP1BAP07359 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GP1BAP07359 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GP1BAP07359 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GP1BAP07359 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GP1BAP07359 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GP1BAP07359 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GP1BAP07359 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GP1BAP07359 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GP1BAP07359 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GP1BAP07359 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GP1BAP07359 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GP1BAP07359 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GP1BAP07359 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GP1BAP07359 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GP1BAP07359 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GP1BAP07359 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GP1BAP07359 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GP1BAP07359 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GP1BAP07359 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms