Protein–RNA interactions for Protein: P06858

LPL, Lipoprotein lipase, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPLP06858 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LPLP06858 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LPLP06858 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LPLP06858 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LPLP06858 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LPLP06858 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LPLP06858 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LPLP06858 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LPLP06858 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LPLP06858 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LPLP06858 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LPLP06858 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LPLP06858 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LPLP06858 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LPLP06858 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LPLP06858 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LPLP06858 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LPLP06858 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LPLP06858 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LPLP06858 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LPLP06858 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LPLP06858 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LPLP06858 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LPLP06858 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LPLP06858 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LPLP06858 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LPLP06858 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LPLP06858 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LPLP06858 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LPLP06858 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LPLP06858 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LPLP06858 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LPLP06858 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LPLP06858 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LPLP06858 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LPLP06858 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LPLP06858 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LPLP06858 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LPLP06858 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LPLP06858 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LPLP06858 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LPLP06858 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LPLP06858 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LPLP06858 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LPLP06858 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LPLP06858 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LPLP06858 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LPLP06858 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LPLP06858 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LPLP06858 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LPLP06858 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LPLP06858 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LPLP06858 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LPLP06858 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LPLP06858 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LPLP06858 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LPLP06858 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LPLP06858 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LPLP06858 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LPLP06858 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LPLP06858 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LPLP06858 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LPLP06858 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LPLP06858 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LPLP06858 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LPLP06858 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LPLP06858 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LPLP06858 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LPLP06858 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LPLP06858 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LPLP06858 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LPLP06858 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
LPLP06858 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LPLP06858 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LPLP06858 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LPLP06858 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LPLP06858 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LPLP06858 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LPLP06858 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LPLP06858 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LPLP06858 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LPLP06858 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LPLP06858 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LPLP06858 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LPLP06858 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LPLP06858 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LPLP06858 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LPLP06858 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LPLP06858 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LPLP06858 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LPLP06858 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LPLP06858 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LPLP06858 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LPLP06858 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LPLP06858 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LPLP06858 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LPLP06858 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LPLP06858 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LPLP06858 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LPLP06858 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms