Protein–RNA interactions for Protein: P05937

CALB1, Calbindin, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB1P05937 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALB1P05937 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CALB1P05937 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALB1P05937 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALB1P05937 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALB1P05937 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CALB1P05937 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALB1P05937 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CALB1P05937 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CALB1P05937 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CALB1P05937 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CALB1P05937 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CALB1P05937 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALB1P05937 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALB1P05937 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALB1P05937 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALB1P05937 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALB1P05937 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALB1P05937 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALB1P05937 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALB1P05937 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALB1P05937 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALB1P05937 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALB1P05937 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALB1P05937 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALB1P05937 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALB1P05937 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALB1P05937 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CALB1P05937 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALB1P05937 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALB1P05937 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALB1P05937 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALB1P05937 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALB1P05937 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CALB1P05937 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALB1P05937 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALB1P05937 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALB1P05937 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALB1P05937 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALB1P05937 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALB1P05937 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALB1P05937 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALB1P05937 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CALB1P05937 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALB1P05937 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CALB1P05937 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CALB1P05937 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CALB1P05937 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CALB1P05937 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CALB1P05937 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CALB1P05937 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CALB1P05937 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CALB1P05937 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CALB1P05937 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CALB1P05937 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CALB1P05937 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CALB1P05937 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALB1P05937 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALB1P05937 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CALB1P05937 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALB1P05937 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALB1P05937 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALB1P05937 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALB1P05937 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALB1P05937 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALB1P05937 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALB1P05937 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALB1P05937 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALB1P05937 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALB1P05937 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALB1P05937 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALB1P05937 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALB1P05937 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALB1P05937 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALB1P05937 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALB1P05937 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALB1P05937 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALB1P05937 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALB1P05937 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALB1P05937 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALB1P05937 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALB1P05937 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALB1P05937 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CALB1P05937 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALB1P05937 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALB1P05937 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALB1P05937 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALB1P05937 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALB1P05937 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALB1P05937 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALB1P05937 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALB1P05937 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALB1P05937 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALB1P05937 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALB1P05937 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALB1P05937 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALB1P05937 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALB1P05937 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALB1P05937 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALB1P05937 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms