Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYBBP04839 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYBBP04839 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYBBP04839 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYBBP04839 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYBBP04839 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYBBP04839 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYBBP04839 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYBBP04839 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYBBP04839 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYBBP04839 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYBBP04839 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYBBP04839 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYBBP04839 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYBBP04839 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYBBP04839 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYBBP04839 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYBBP04839 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYBBP04839 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYBBP04839 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYBBP04839 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYBBP04839 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYBBP04839 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYBBP04839 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYBBP04839 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYBBP04839 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYBBP04839 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYBBP04839 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYBBP04839 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYBBP04839 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYBBP04839 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYBBP04839 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYBBP04839 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYBBP04839 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CYBBP04839 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYBBP04839 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYBBP04839 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYBBP04839 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYBBP04839 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYBBP04839 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYBBP04839 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYBBP04839 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CYBBP04839 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYBBP04839 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYBBP04839 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYBBP04839 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYBBP04839 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYBBP04839 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYBBP04839 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYBBP04839 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYBBP04839 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYBBP04839 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYBBP04839 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CYBBP04839 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYBBP04839 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYBBP04839 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYBBP04839 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYBBP04839 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYBBP04839 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYBBP04839 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYBBP04839 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYBBP04839 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYBBP04839 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYBBP04839 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYBBP04839 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYBBP04839 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYBBP04839 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYBBP04839 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYBBP04839 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYBBP04839 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYBBP04839 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYBBP04839 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CYBBP04839 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYBBP04839 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CYBBP04839 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYBBP04839 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYBBP04839 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CYBBP04839 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CYBBP04839 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CYBBP04839 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYBBP04839 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYBBP04839 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYBBP04839 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYBBP04839 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYBBP04839 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYBBP04839 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYBBP04839 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYBBP04839 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYBBP04839 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYBBP04839 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYBBP04839 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYBBP04839 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYBBP04839 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYBBP04839 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYBBP04839 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYBBP04839 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYBBP04839 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYBBP04839 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYBBP04839 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CYBBP04839 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.1 ms