Protein–RNA interactions for Protein: P02745

C1QA, Complement C1q subcomponent subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QAP02745 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1QAP02745 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1QAP02745 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1QAP02745 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1QAP02745 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1QAP02745 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1QAP02745 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C1QAP02745 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1QAP02745 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1QAP02745 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1QAP02745 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1QAP02745 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1QAP02745 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1QAP02745 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1QAP02745 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1QAP02745 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1QAP02745 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
C1QAP02745 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1QAP02745 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1QAP02745 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1QAP02745 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1QAP02745 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1QAP02745 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1QAP02745 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C1QAP02745 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C1QAP02745 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C1QAP02745 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1QAP02745 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1QAP02745 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1QAP02745 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QAP02745 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QAP02745 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QAP02745 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QAP02745 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QAP02745 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QAP02745 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QAP02745 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QAP02745 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QAP02745 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QAP02745 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QAP02745 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QAP02745 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QAP02745 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QAP02745 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QAP02745 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QAP02745 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QAP02745 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QAP02745 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QAP02745 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QAP02745 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QAP02745 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QAP02745 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QAP02745 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QAP02745 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QAP02745 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QAP02745 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QAP02745 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QAP02745 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QAP02745 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QAP02745 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QAP02745 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QAP02745 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1QAP02745 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1QAP02745 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1QAP02745 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
C1QAP02745 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1QAP02745 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1QAP02745 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1QAP02745 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1QAP02745 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1QAP02745 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1QAP02745 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1QAP02745 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1QAP02745 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1QAP02745 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1QAP02745 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1QAP02745 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1QAP02745 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1QAP02745 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1QAP02745 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1QAP02745 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1QAP02745 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C1QAP02745 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C1QAP02745 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1QAP02745 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1QAP02745 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1QAP02745 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1QAP02745 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1QAP02745 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1QAP02745 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1QAP02745 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1QAP02745 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1QAP02745 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1QAP02745 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1QAP02745 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C1QAP02745 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1QAP02745 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1QAP02745 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1QAP02745 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1QAP02745 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms