Protein–RNA interactions for Protein: P01772

IGHV3-33, Immunoglobulin heavy variable 3-33, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-33P01772 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IGHV3-33P01772 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms