Protein–RNA interactions for Protein: O96017

CHEK2, Serine/threonine-protein kinase Chk2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHEK2O96017 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHEK2O96017 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHEK2O96017 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHEK2O96017 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHEK2O96017 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHEK2O96017 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHEK2O96017 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHEK2O96017 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHEK2O96017 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHEK2O96017 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHEK2O96017 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHEK2O96017 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHEK2O96017 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHEK2O96017 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHEK2O96017 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHEK2O96017 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHEK2O96017 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHEK2O96017 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHEK2O96017 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHEK2O96017 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHEK2O96017 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHEK2O96017 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHEK2O96017 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHEK2O96017 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHEK2O96017 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms