Protein–RNA interactions for Protein: O96015

DNAL4, Dynein light chain 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAL4O96015 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAL4O96015 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAL4O96015 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAL4O96015 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAL4O96015 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAL4O96015 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAL4O96015 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAL4O96015 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNAL4O96015 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNAL4O96015 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNAL4O96015 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNAL4O96015 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms