Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCNTO95613 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCNTO95613 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCNTO95613 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCNTO95613 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCNTO95613 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCNTO95613 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCNTO95613 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCNTO95613 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCNTO95613 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCNTO95613 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCNTO95613 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCNTO95613 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCNTO95613 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCNTO95613 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCNTO95613 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCNTO95613 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCNTO95613 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCNTO95613 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCNTO95613 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCNTO95613 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCNTO95613 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCNTO95613 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCNTO95613 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCNTO95613 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCNTO95613 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCNTO95613 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCNTO95613 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCNTO95613 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PCNTO95613 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCNTO95613 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PCNTO95613 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PCNTO95613 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCNTO95613 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCNTO95613 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PCNTO95613 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCNTO95613 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCNTO95613 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCNTO95613 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCNTO95613 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCNTO95613 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCNTO95613 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCNTO95613 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCNTO95613 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCNTO95613 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCNTO95613 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCNTO95613 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCNTO95613 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCNTO95613 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PCNTO95613 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCNTO95613 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCNTO95613 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCNTO95613 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PCNTO95613 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PCNTO95613 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PCNTO95613 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCNTO95613 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCNTO95613 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCNTO95613 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCNTO95613 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCNTO95613 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCNTO95613 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCNTO95613 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCNTO95613 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCNTO95613 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCNTO95613 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCNTO95613 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCNTO95613 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCNTO95613 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCNTO95613 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCNTO95613 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCNTO95613 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCNTO95613 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCNTO95613 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PCNTO95613 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCNTO95613 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCNTO95613 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCNTO95613 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCNTO95613 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCNTO95613 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCNTO95613 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCNTO95613 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCNTO95613 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PCNTO95613 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCNTO95613 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCNTO95613 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PCNTO95613 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCNTO95613 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCNTO95613 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCNTO95613 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCNTO95613 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCNTO95613 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCNTO95613 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCNTO95613 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCNTO95613 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PCNTO95613 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCNTO95613 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCNTO95613 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCNTO95613 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCNTO95613 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms