Protein–RNA interactions for Protein: O95521

PRAMEF1, PRAME family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF1O95521 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF1O95521 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF1O95521 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF1O95521 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF1O95521 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF1O95521 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF1O95521 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF1O95521 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF1O95521 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF1O95521 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms