Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCB11O95342 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCB11O95342 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCB11O95342 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCB11O95342 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCB11O95342 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCB11O95342 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ABCB11O95342 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ABCB11O95342 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCB11O95342 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCB11O95342 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCB11O95342 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCB11O95342 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCB11O95342 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCB11O95342 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCB11O95342 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCB11O95342 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCB11O95342 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCB11O95342 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCB11O95342 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCB11O95342 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCB11O95342 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCB11O95342 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCB11O95342 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCB11O95342 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCB11O95342 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCB11O95342 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCB11O95342 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCB11O95342 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCB11O95342 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCB11O95342 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCB11O95342 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCB11O95342 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCB11O95342 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCB11O95342 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCB11O95342 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCB11O95342 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCB11O95342 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCB11O95342 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCB11O95342 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCB11O95342 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCB11O95342 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCB11O95342 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCB11O95342 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCB11O95342 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCB11O95342 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCB11O95342 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCB11O95342 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCB11O95342 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCB11O95342 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCB11O95342 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCB11O95342 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms