Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRPM2O94759 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRPM2O94759 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRPM2O94759 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRPM2O94759 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRPM2O94759 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRPM2O94759 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRPM2O94759 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRPM2O94759 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRPM2O94759 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRPM2O94759 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
TRPM2O94759 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
TRPM2O94759 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TRPM2O94759 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRPM2O94759 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRPM2O94759 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRPM2O94759 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
TRPM2O94759 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
TRPM2O94759 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRPM2O94759 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRPM2O94759 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRPM2O94759 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRPM2O94759 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRPM2O94759 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRPM2O94759 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRPM2O94759 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRPM2O94759 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRPM2O94759 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRPM2O94759 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
TRPM2O94759 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TRPM2O94759 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TRPM2O94759 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TRPM2O94759 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TRPM2O94759 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TRPM2O94759 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TRPM2O94759 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TRPM2O94759 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TRPM2O94759 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRPM2O94759 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRPM2O94759 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRPM2O94759 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRPM2O94759 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
TRPM2O94759 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
TRPM2O94759 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
TRPM2O94759 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRPM2O94759 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRPM2O94759 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRPM2O94759 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC34■■■■□ 3.03
TRPM2O94759 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
TRPM2O94759 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC34■■■■□ 3.03
TRPM2O94759 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
TRPM2O94759 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
TRPM2O94759 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
TRPM2O94759 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TRPM2O94759 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRPM2O94759 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRPM2O94759 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRPM2O94759 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRPM2O94759 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRPM2O94759 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRPM2O94759 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRPM2O94759 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRPM2O94759 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRPM2O94759 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRPM2O94759 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRPM2O94759 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRPM2O94759 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRPM2O94759 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRPM2O94759 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRPM2O94759 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRPM2O94759 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRPM2O94759 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRPM2O94759 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRPM2O94759 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRPM2O94759 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRPM2O94759 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRPM2O94759 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
TRPM2O94759 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRPM2O94759 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRPM2O94759 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRPM2O94759 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TRPM2O94759 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TRPM2O94759 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TRPM2O94759 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
TRPM2O94759 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRPM2O94759 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRPM2O94759 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRPM2O94759 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRPM2O94759 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
TRPM2O94759 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRPM2O94759 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRPM2O94759 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRPM2O94759 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRPM2O94759 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRPM2O94759 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRPM2O94759 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRPM2O94759 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRPM2O94759 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRPM2O94759 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRPM2O94759 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms