Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FLOT1O75955 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FLOT1O75955 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FLOT1O75955 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FLOT1O75955 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FLOT1O75955 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FLOT1O75955 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FLOT1O75955 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FLOT1O75955 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FLOT1O75955 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FLOT1O75955 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FLOT1O75955 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FLOT1O75955 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FLOT1O75955 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FLOT1O75955 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FLOT1O75955 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FLOT1O75955 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FLOT1O75955 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FLOT1O75955 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FLOT1O75955 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FLOT1O75955 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FLOT1O75955 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FLOT1O75955 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FLOT1O75955 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FLOT1O75955 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FLOT1O75955 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FLOT1O75955 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FLOT1O75955 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FLOT1O75955 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FLOT1O75955 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FLOT1O75955 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FLOT1O75955 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FLOT1O75955 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FLOT1O75955 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FLOT1O75955 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FLOT1O75955 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FLOT1O75955 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FLOT1O75955 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FLOT1O75955 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FLOT1O75955 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FLOT1O75955 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FLOT1O75955 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FLOT1O75955 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FLOT1O75955 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FLOT1O75955 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FLOT1O75955 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FLOT1O75955 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
FLOT1O75955 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
FLOT1O75955 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
FLOT1O75955 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
FLOT1O75955 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FLOT1O75955 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FLOT1O75955 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FLOT1O75955 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FLOT1O75955 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FLOT1O75955 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FLOT1O75955 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
FLOT1O75955 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FLOT1O75955 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FLOT1O75955 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FLOT1O75955 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FLOT1O75955 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FLOT1O75955 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FLOT1O75955 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FLOT1O75955 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FLOT1O75955 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FLOT1O75955 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FLOT1O75955 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FLOT1O75955 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FLOT1O75955 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FLOT1O75955 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FLOT1O75955 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FLOT1O75955 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FLOT1O75955 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FLOT1O75955 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FLOT1O75955 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FLOT1O75955 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FLOT1O75955 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FLOT1O75955 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FLOT1O75955 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
FLOT1O75955 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FLOT1O75955 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FLOT1O75955 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FLOT1O75955 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FLOT1O75955 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FLOT1O75955 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FLOT1O75955 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FLOT1O75955 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FLOT1O75955 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FLOT1O75955 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FLOT1O75955 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FLOT1O75955 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FLOT1O75955 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FLOT1O75955 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FLOT1O75955 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FLOT1O75955 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FLOT1O75955 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FLOT1O75955 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FLOT1O75955 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FLOT1O75955 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms