Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
VAMP4O75379 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
VAMP4O75379 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
VAMP4O75379 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
VAMP4O75379 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
VAMP4O75379 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
VAMP4O75379 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
VAMP4O75379 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
VAMP4O75379 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
VAMP4O75379 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
VAMP4O75379 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
VAMP4O75379 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
VAMP4O75379 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
VAMP4O75379 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
VAMP4O75379 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
VAMP4O75379 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
VAMP4O75379 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
VAMP4O75379 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VAMP4O75379 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VAMP4O75379 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
VAMP4O75379 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
VAMP4O75379 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
VAMP4O75379 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
VAMP4O75379 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
VAMP4O75379 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
VAMP4O75379 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
VAMP4O75379 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
VAMP4O75379 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
VAMP4O75379 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
VAMP4O75379 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
VAMP4O75379 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
VAMP4O75379 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
VAMP4O75379 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
VAMP4O75379 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
VAMP4O75379 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
VAMP4O75379 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
VAMP4O75379 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
VAMP4O75379 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
VAMP4O75379 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
VAMP4O75379 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
VAMP4O75379 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
VAMP4O75379 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
VAMP4O75379 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
VAMP4O75379 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
VAMP4O75379 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
VAMP4O75379 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
VAMP4O75379 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
VAMP4O75379 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
VAMP4O75379 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
VAMP4O75379 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
VAMP4O75379 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
VAMP4O75379 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
VAMP4O75379 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
VAMP4O75379 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
VAMP4O75379 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
VAMP4O75379 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
VAMP4O75379 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
VAMP4O75379 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
VAMP4O75379 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
VAMP4O75379 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
VAMP4O75379 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
VAMP4O75379 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
VAMP4O75379 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
VAMP4O75379 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
VAMP4O75379 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
VAMP4O75379 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
VAMP4O75379 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
VAMP4O75379 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
VAMP4O75379 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
VAMP4O75379 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
VAMP4O75379 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
VAMP4O75379 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
VAMP4O75379 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
VAMP4O75379 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
VAMP4O75379 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
VAMP4O75379 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
VAMP4O75379 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
VAMP4O75379 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
VAMP4O75379 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
VAMP4O75379 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
VAMP4O75379 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
VAMP4O75379 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
VAMP4O75379 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
VAMP4O75379 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
VAMP4O75379 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
VAMP4O75379 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
VAMP4O75379 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
VAMP4O75379 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
VAMP4O75379 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
VAMP4O75379 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
VAMP4O75379 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
VAMP4O75379 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
VAMP4O75379 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
VAMP4O75379 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
VAMP4O75379 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
VAMP4O75379 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
VAMP4O75379 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VAMP4O75379 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VAMP4O75379 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VAMP4O75379 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms