Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PPFIA4O75335 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIA4O75335 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIA4O75335 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIA4O75335 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIA4O75335 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIA4O75335 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIA4O75335 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIA4O75335 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIA4O75335 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIA4O75335 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PPFIA4O75335 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPFIA4O75335 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPFIA4O75335 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPFIA4O75335 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PPFIA4O75335 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPFIA4O75335 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPFIA4O75335 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPFIA4O75335 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPFIA4O75335 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPFIA4O75335 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPFIA4O75335 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPFIA4O75335 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPFIA4O75335 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPFIA4O75335 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PPFIA4O75335 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PPFIA4O75335 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PPFIA4O75335 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PPFIA4O75335 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIA4O75335 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPFIA4O75335 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPFIA4O75335 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPFIA4O75335 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PPFIA4O75335 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPFIA4O75335 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPFIA4O75335 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPFIA4O75335 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPFIA4O75335 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPFIA4O75335 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPFIA4O75335 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPFIA4O75335 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPFIA4O75335 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPFIA4O75335 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms