Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSVO60911 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSVO60911 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSVO60911 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSVO60911 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSVO60911 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSVO60911 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSVO60911 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSVO60911 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSVO60911 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSVO60911 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSVO60911 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSVO60911 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSVO60911 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSVO60911 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSVO60911 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSVO60911 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSVO60911 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSVO60911 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSVO60911 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSVO60911 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSVO60911 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSVO60911 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSVO60911 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSVO60911 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSVO60911 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSVO60911 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSVO60911 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSVO60911 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSVO60911 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSVO60911 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSVO60911 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSVO60911 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSVO60911 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSVO60911 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSVO60911 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTSVO60911 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSVO60911 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSVO60911 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSVO60911 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSVO60911 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSVO60911 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSVO60911 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSVO60911 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSVO60911 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSVO60911 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSVO60911 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSVO60911 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSVO60911 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSVO60911 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSVO60911 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSVO60911 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSVO60911 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSVO60911 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSVO60911 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSVO60911 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSVO60911 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSVO60911 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSVO60911 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSVO60911 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSVO60911 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSVO60911 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSVO60911 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSVO60911 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSVO60911 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSVO60911 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSVO60911 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSVO60911 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSVO60911 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSVO60911 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSVO60911 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSVO60911 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSVO60911 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSVO60911 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSVO60911 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSVO60911 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSVO60911 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSVO60911 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSVO60911 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSVO60911 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSVO60911 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSVO60911 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSVO60911 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSVO60911 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CTSVO60911 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSVO60911 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSVO60911 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSVO60911 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSVO60911 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSVO60911 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSVO60911 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSVO60911 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSVO60911 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSVO60911 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSVO60911 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSVO60911 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSVO60911 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSVO60911 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSVO60911 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSVO60911 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms