Protein–RNA interactions for Protein: O60671

RAD1, Cell cycle checkpoint protein RAD1, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD1O60671 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD1O60671 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD1O60671 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD1O60671 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD1O60671 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD1O60671 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD1O60671 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD1O60671 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD1O60671 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD1O60671 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD1O60671 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD1O60671 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD1O60671 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD1O60671 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD1O60671 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD1O60671 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD1O60671 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD1O60671 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD1O60671 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD1O60671 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD1O60671 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD1O60671 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD1O60671 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD1O60671 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD1O60671 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD1O60671 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD1O60671 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD1O60671 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAD1O60671 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAD1O60671 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD1O60671 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD1O60671 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD1O60671 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD1O60671 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD1O60671 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD1O60671 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD1O60671 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD1O60671 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD1O60671 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD1O60671 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD1O60671 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD1O60671 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD1O60671 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD1O60671 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD1O60671 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD1O60671 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD1O60671 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD1O60671 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD1O60671 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD1O60671 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD1O60671 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD1O60671 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD1O60671 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD1O60671 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD1O60671 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD1O60671 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD1O60671 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD1O60671 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD1O60671 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD1O60671 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD1O60671 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD1O60671 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD1O60671 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD1O60671 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD1O60671 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD1O60671 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD1O60671 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD1O60671 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD1O60671 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD1O60671 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD1O60671 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD1O60671 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD1O60671 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD1O60671 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD1O60671 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD1O60671 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD1O60671 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAD1O60671 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAD1O60671 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD1O60671 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD1O60671 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD1O60671 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD1O60671 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD1O60671 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD1O60671 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD1O60671 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD1O60671 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD1O60671 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD1O60671 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD1O60671 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD1O60671 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD1O60671 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD1O60671 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD1O60671 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD1O60671 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD1O60671 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD1O60671 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD1O60671 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD1O60671 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD1O60671 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms