Protein–RNA interactions for Protein: O60609

GFRA3, GDNF family receptor alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA3O60609 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GFRA3O60609 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GFRA3O60609 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GFRA3O60609 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GFRA3O60609 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GFRA3O60609 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GFRA3O60609 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GFRA3O60609 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GFRA3O60609 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GFRA3O60609 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GFRA3O60609 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GFRA3O60609 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GFRA3O60609 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GFRA3O60609 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GFRA3O60609 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GFRA3O60609 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GFRA3O60609 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GFRA3O60609 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GFRA3O60609 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GFRA3O60609 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GFRA3O60609 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GFRA3O60609 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GFRA3O60609 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GFRA3O60609 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GFRA3O60609 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GFRA3O60609 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GFRA3O60609 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GFRA3O60609 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GFRA3O60609 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GFRA3O60609 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GFRA3O60609 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GFRA3O60609 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GFRA3O60609 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GFRA3O60609 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GFRA3O60609 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GFRA3O60609 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GFRA3O60609 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GFRA3O60609 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GFRA3O60609 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GFRA3O60609 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms