Protein–RNA interactions for Protein: O60500

NPHS1, Nephrin, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS1O60500 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPHS1O60500 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHS1O60500 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHS1O60500 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHS1O60500 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHS1O60500 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHS1O60500 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHS1O60500 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHS1O60500 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHS1O60500 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPHS1O60500 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPHS1O60500 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPHS1O60500 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPHS1O60500 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPHS1O60500 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPHS1O60500 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPHS1O60500 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NPHS1O60500 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPHS1O60500 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPHS1O60500 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPHS1O60500 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPHS1O60500 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPHS1O60500 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPHS1O60500 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPHS1O60500 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPHS1O60500 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPHS1O60500 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPHS1O60500 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPHS1O60500 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPHS1O60500 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPHS1O60500 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPHS1O60500 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPHS1O60500 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPHS1O60500 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPHS1O60500 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPHS1O60500 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPHS1O60500 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPHS1O60500 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPHS1O60500 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPHS1O60500 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPHS1O60500 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPHS1O60500 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms