Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAK2O60296 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAK2O60296 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAK2O60296 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAK2O60296 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAK2O60296 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAK2O60296 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAK2O60296 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAK2O60296 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAK2O60296 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAK2O60296 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAK2O60296 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAK2O60296 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAK2O60296 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAK2O60296 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAK2O60296 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRAK2O60296 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAK2O60296 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAK2O60296 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAK2O60296 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAK2O60296 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAK2O60296 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAK2O60296 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAK2O60296 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAK2O60296 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAK2O60296 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAK2O60296 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAK2O60296 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAK2O60296 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAK2O60296 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAK2O60296 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAK2O60296 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAK2O60296 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAK2O60296 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAK2O60296 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAK2O60296 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAK2O60296 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAK2O60296 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAK2O60296 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAK2O60296 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAK2O60296 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAK2O60296 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAK2O60296 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAK2O60296 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAK2O60296 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAK2O60296 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAK2O60296 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAK2O60296 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAK2O60296 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAK2O60296 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAK2O60296 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAK2O60296 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAK2O60296 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAK2O60296 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAK2O60296 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAK2O60296 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAK2O60296 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAK2O60296 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAK2O60296 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAK2O60296 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAK2O60296 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAK2O60296 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAK2O60296 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAK2O60296 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAK2O60296 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAK2O60296 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAK2O60296 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAK2O60296 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAK2O60296 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAK2O60296 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAK2O60296 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAK2O60296 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAK2O60296 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAK2O60296 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAK2O60296 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAK2O60296 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAK2O60296 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAK2O60296 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAK2O60296 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAK2O60296 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAK2O60296 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAK2O60296 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAK2O60296 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAK2O60296 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAK2O60296 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAK2O60296 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAK2O60296 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAK2O60296 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAK2O60296 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAK2O60296 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAK2O60296 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAK2O60296 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAK2O60296 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAK2O60296 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAK2O60296 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAK2O60296 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAK2O60296 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAK2O60296 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAK2O60296 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAK2O60296 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms