Protein–RNA interactions for Protein: O43933

PEX1, Peroxisome biogenesis factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX1O43933 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX1O43933 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX1O43933 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX1O43933 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX1O43933 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX1O43933 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX1O43933 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX1O43933 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX1O43933 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX1O43933 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX1O43933 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX1O43933 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX1O43933 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX1O43933 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX1O43933 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX1O43933 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX1O43933 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX1O43933 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX1O43933 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX1O43933 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX1O43933 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX1O43933 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX1O43933 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX1O43933 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX1O43933 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX1O43933 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX1O43933 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX1O43933 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX1O43933 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX1O43933 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX1O43933 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX1O43933 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX1O43933 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX1O43933 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX1O43933 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX1O43933 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX1O43933 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX1O43933 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX1O43933 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX1O43933 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX1O43933 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX1O43933 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX1O43933 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX1O43933 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX1O43933 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX1O43933 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX1O43933 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX1O43933 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX1O43933 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX1O43933 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX1O43933 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX1O43933 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX1O43933 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX1O43933 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX1O43933 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX1O43933 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX1O43933 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX1O43933 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX1O43933 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX1O43933 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX1O43933 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX1O43933 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX1O43933 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX1O43933 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX1O43933 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX1O43933 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX1O43933 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX1O43933 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX1O43933 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX1O43933 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX1O43933 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX1O43933 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX1O43933 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX1O43933 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX1O43933 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX1O43933 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX1O43933 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX1O43933 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX1O43933 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX1O43933 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX1O43933 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX1O43933 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX1O43933 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX1O43933 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX1O43933 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX1O43933 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX1O43933 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX1O43933 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX1O43933 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX1O43933 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX1O43933 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX1O43933 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX1O43933 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX1O43933 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX1O43933 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX1O43933 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX1O43933 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX1O43933 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX1O43933 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX1O43933 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms