Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP9BO43861 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP9BO43861 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms