Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KDELR3O43731 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDELR3O43731 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDELR3O43731 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDELR3O43731 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDELR3O43731 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDELR3O43731 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KDELR3O43731 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDELR3O43731 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDELR3O43731 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDELR3O43731 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDELR3O43731 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KDELR3O43731 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDELR3O43731 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDELR3O43731 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDELR3O43731 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDELR3O43731 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDELR3O43731 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDELR3O43731 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDELR3O43731 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDELR3O43731 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDELR3O43731 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDELR3O43731 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDELR3O43731 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDELR3O43731 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDELR3O43731 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDELR3O43731 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDELR3O43731 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDELR3O43731 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
KDELR3O43731 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDELR3O43731 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
KDELR3O43731 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDELR3O43731 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDELR3O43731 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDELR3O43731 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDELR3O43731 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDELR3O43731 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDELR3O43731 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KDELR3O43731 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDELR3O43731 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDELR3O43731 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDELR3O43731 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KDELR3O43731 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KDELR3O43731 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KDELR3O43731 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KDELR3O43731 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KDELR3O43731 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KDELR3O43731 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDELR3O43731 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDELR3O43731 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDELR3O43731 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDELR3O43731 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDELR3O43731 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDELR3O43731 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDELR3O43731 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDELR3O43731 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDELR3O43731 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDELR3O43731 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDELR3O43731 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KDELR3O43731 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDELR3O43731 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDELR3O43731 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDELR3O43731 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDELR3O43731 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDELR3O43731 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDELR3O43731 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KDELR3O43731 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDELR3O43731 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDELR3O43731 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDELR3O43731 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDELR3O43731 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDELR3O43731 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDELR3O43731 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDELR3O43731 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDELR3O43731 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDELR3O43731 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDELR3O43731 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDELR3O43731 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDELR3O43731 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDELR3O43731 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDELR3O43731 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDELR3O43731 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDELR3O43731 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms