Protein–RNA interactions for Protein: O43657

TSPAN6, Tetraspanin-6, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN6O43657 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN6O43657 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms