Protein–RNA interactions for Protein: O43615

TIMM44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44O43615 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TIMM44O43615 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TIMM44O43615 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIMM44O43615 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIMM44O43615 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIMM44O43615 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIMM44O43615 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIMM44O43615 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIMM44O43615 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIMM44O43615 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TIMM44O43615 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIMM44O43615 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIMM44O43615 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIMM44O43615 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIMM44O43615 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIMM44O43615 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TIMM44O43615 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIMM44O43615 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIMM44O43615 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIMM44O43615 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIMM44O43615 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIMM44O43615 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TIMM44O43615 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIMM44O43615 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIMM44O43615 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TIMM44O43615 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TIMM44O43615 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TIMM44O43615 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TIMM44O43615 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TIMM44O43615 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TIMM44O43615 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TIMM44O43615 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TIMM44O43615 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TIMM44O43615 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TIMM44O43615 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TIMM44O43615 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TIMM44O43615 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TIMM44O43615 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TIMM44O43615 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TIMM44O43615 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TIMM44O43615 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TIMM44O43615 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TIMM44O43615 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TIMM44O43615 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TIMM44O43615 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TIMM44O43615 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TIMM44O43615 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TIMM44O43615 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TIMM44O43615 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TIMM44O43615 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TIMM44O43615 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TIMM44O43615 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TIMM44O43615 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TIMM44O43615 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TIMM44O43615 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TIMM44O43615 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIMM44O43615 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIMM44O43615 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIMM44O43615 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TIMM44O43615 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIMM44O43615 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms