Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNAB3O43448 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNAB3O43448 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNAB3O43448 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNAB3O43448 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNAB3O43448 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNAB3O43448 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNAB3O43448 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNAB3O43448 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNAB3O43448 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNAB3O43448 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNAB3O43448 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNAB3O43448 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNAB3O43448 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNAB3O43448 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNAB3O43448 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNAB3O43448 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNAB3O43448 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNAB3O43448 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNAB3O43448 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNAB3O43448 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNAB3O43448 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNAB3O43448 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNAB3O43448 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNAB3O43448 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNAB3O43448 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNAB3O43448 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNAB3O43448 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNAB3O43448 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNAB3O43448 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNAB3O43448 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNAB3O43448 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNAB3O43448 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCNAB3O43448 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNAB3O43448 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KCNAB3O43448 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms