Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSI1O43347 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MSI1O43347 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSI1O43347 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSI1O43347 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSI1O43347 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MSI1O43347 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MSI1O43347 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MSI1O43347 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MSI1O43347 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
MSI1O43347 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MSI1O43347 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSI1O43347 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSI1O43347 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSI1O43347 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSI1O43347 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSI1O43347 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MSI1O43347 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSI1O43347 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSI1O43347 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSI1O43347 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSI1O43347 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSI1O43347 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSI1O43347 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSI1O43347 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSI1O43347 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSI1O43347 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSI1O43347 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MSI1O43347 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSI1O43347 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSI1O43347 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSI1O43347 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSI1O43347 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSI1O43347 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MSI1O43347 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSI1O43347 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSI1O43347 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSI1O43347 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSI1O43347 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSI1O43347 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSI1O43347 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSI1O43347 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSI1O43347 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSI1O43347 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MSI1O43347 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSI1O43347 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSI1O43347 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MSI1O43347 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSI1O43347 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSI1O43347 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MSI1O43347 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSI1O43347 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSI1O43347 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSI1O43347 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSI1O43347 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSI1O43347 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSI1O43347 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSI1O43347 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MSI1O43347 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSI1O43347 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSI1O43347 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSI1O43347 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSI1O43347 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSI1O43347 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSI1O43347 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSI1O43347 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSI1O43347 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSI1O43347 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSI1O43347 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSI1O43347 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MSI1O43347 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MSI1O43347 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSI1O43347 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSI1O43347 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSI1O43347 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSI1O43347 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSI1O43347 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSI1O43347 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSI1O43347 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSI1O43347 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSI1O43347 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSI1O43347 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSI1O43347 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSI1O43347 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSI1O43347 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSI1O43347 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSI1O43347 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSI1O43347 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSI1O43347 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSI1O43347 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSI1O43347 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSI1O43347 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSI1O43347 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSI1O43347 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSI1O43347 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSI1O43347 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSI1O43347 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MSI1O43347 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSI1O43347 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSI1O43347 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms