Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MTSS1O43312 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
MTSS1O43312 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MTSS1O43312 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTSS1O43312 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTSS1O43312 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTSS1O43312 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTSS1O43312 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTSS1O43312 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTSS1O43312 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTSS1O43312 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTSS1O43312 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTSS1O43312 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTSS1O43312 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTSS1O43312 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTSS1O43312 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTSS1O43312 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTSS1O43312 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTSS1O43312 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTSS1O43312 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTSS1O43312 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MTSS1O43312 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTSS1O43312 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTSS1O43312 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTSS1O43312 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MTSS1O43312 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTSS1O43312 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTSS1O43312 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTSS1O43312 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTSS1O43312 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTSS1O43312 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTSS1O43312 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTSS1O43312 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTSS1O43312 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTSS1O43312 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTSS1O43312 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTSS1O43312 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTSS1O43312 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTSS1O43312 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTSS1O43312 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTSS1O43312 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTSS1O43312 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTSS1O43312 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 237 ms