Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRXO43186 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRXO43186 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRXO43186 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRXO43186 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRXO43186 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRXO43186 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRXO43186 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRXO43186 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRXO43186 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRXO43186 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CRXO43186 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRXO43186 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRXO43186 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRXO43186 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRXO43186 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRXO43186 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRXO43186 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRXO43186 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRXO43186 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRXO43186 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRXO43186 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRXO43186 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CRXO43186 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRXO43186 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRXO43186 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRXO43186 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRXO43186 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRXO43186 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CRXO43186 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRXO43186 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRXO43186 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRXO43186 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRXO43186 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRXO43186 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRXO43186 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRXO43186 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRXO43186 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRXO43186 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CRXO43186 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CRXO43186 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CRXO43186 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CRXO43186 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CRXO43186 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CRXO43186 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CRXO43186 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CRXO43186 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CRXO43186 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CRXO43186 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CRXO43186 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CRXO43186 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CRXO43186 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CRXO43186 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CRXO43186 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CRXO43186 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CRXO43186 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CRXO43186 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CRXO43186 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CRXO43186 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CRXO43186 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CRXO43186 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CRXO43186 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CRXO43186 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CRXO43186 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CRXO43186 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CRXO43186 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CRXO43186 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CRXO43186 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CRXO43186 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CRXO43186 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CRXO43186 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRXO43186 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRXO43186 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRXO43186 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRXO43186 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRXO43186 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRXO43186 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRXO43186 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRXO43186 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRXO43186 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRXO43186 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRXO43186 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRXO43186 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRXO43186 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRXO43186 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRXO43186 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRXO43186 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRXO43186 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRXO43186 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRXO43186 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRXO43186 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRXO43186 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRXO43186 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRXO43186 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRXO43186 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRXO43186 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRXO43186 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CRXO43186 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRXO43186 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRXO43186 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.8 ms