Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLXNB1O43157 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXNB1O43157 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLXNB1O43157 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLXNB1O43157 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLXNB1O43157 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLXNB1O43157 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLXNB1O43157 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLXNB1O43157 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLXNB1O43157 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLXNB1O43157 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLXNB1O43157 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLXNB1O43157 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLXNB1O43157 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLXNB1O43157 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLXNB1O43157 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLXNB1O43157 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLXNB1O43157 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLXNB1O43157 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLXNB1O43157 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLXNB1O43157 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLXNB1O43157 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLXNB1O43157 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLXNB1O43157 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLXNB1O43157 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PLXNB1O43157 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLXNB1O43157 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLXNB1O43157 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLXNB1O43157 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLXNB1O43157 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PLXNB1O43157 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLXNB1O43157 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLXNB1O43157 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PLXNB1O43157 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLXNB1O43157 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLXNB1O43157 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLXNB1O43157 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms