Protein–RNA interactions for Protein: O15544

LINC01565, Protein GR6, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01565O15544 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC01565O15544 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC01565O15544 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC01565O15544 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC01565O15544 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC01565O15544 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC01565O15544 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC01565O15544 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC01565O15544 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC01565O15544 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC01565O15544 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC01565O15544 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC01565O15544 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC01565O15544 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC01565O15544 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC01565O15544 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC01565O15544 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC01565O15544 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC01565O15544 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC01565O15544 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC01565O15544 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC01565O15544 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC01565O15544 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC01565O15544 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC01565O15544 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC01565O15544 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC01565O15544 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC01565O15544 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC01565O15544 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC01565O15544 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC01565O15544 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LINC01565O15544 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC01565O15544 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC01565O15544 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC01565O15544 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC01565O15544 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC01565O15544 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC01565O15544 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC01565O15544 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC01565O15544 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC01565O15544 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC01565O15544 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC01565O15544 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC01565O15544 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC01565O15544 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC01565O15544 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC01565O15544 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC01565O15544 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC01565O15544 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC01565O15544 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC01565O15544 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC01565O15544 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC01565O15544 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC01565O15544 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC01565O15544 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC01565O15544 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC01565O15544 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC01565O15544 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC01565O15544 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC01565O15544 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC01565O15544 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC01565O15544 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC01565O15544 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC01565O15544 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC01565O15544 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC01565O15544 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC01565O15544 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC01565O15544 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC01565O15544 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms