Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CLOCKO15516 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms